论文查重软件工作的基本原理是通过建立文本的特征向量，然后利用相似度算法进行比对，判断文本之间的相似程度。常用的算法包括余弦相似度、Jaccard相似度等。这些算法可以有效地检测出文本中的重复部分和抄袭内容。

论文查重软件工作的过程主要包括文本预处理、特征提取、相似度计算和结果输出等步骤。在文本预处理阶段，会对文本进行去除停用词、分词等操作；特征提取阶段会将文本转化为特征向量；相似度计算阶段会利用算法计算文本之间的相似度；最终输出结果给用户。